BLASTScope Option Help
- <Sort hits order by ...>
並べ替えを行う要素の指定
Hit number(Score) (default)
Bit score
Query from
definition
alignment length
"Query from" を指定し、HIT (相同性が認められたBLAST対象DBの配列) 1件に HSP(連続した相同性の高い領域)
が複数ある場合、最もスコアの高かった HSP で並べ替えを行います。
- -h <Number of Hits> (Integer)
Hit 表示件数の指定
"Limit"のボタンをチェックすると、表示する Hit(相同性が認められたBLAST対象DBの配列) の件数を制限することができます。
件数は右側のボックスで指定してください。
- -h <Number of HSPs> (Integer)
HSP 表示件数の指定
"Limit"のボタンをチェックすると、Hit 1件あたりの HSP(連続した相同性の高い領域)
の表示件数を制限することができます。
HSP は、bit-score の高いものが表示されます。
件数は右側のボックスで指定してください。
- <alignment length> (Integer)
アライメント長の制限
指定した数値よりも長いアライメント長を持つ HSP のみを表示させることができます。
制限を行わない場合は、"0"を入力してください。
- <Range of query sequence> (Integer)
Queryの表示領域を指定
Query(問い合わせ)配列のうち一部の領域と、その領域に相同性をもつデータベースの配列のみを表示させることができます。
左側のボックスに領域の開始位置を、右側のボックスに領域の終了位置を入力してください。
Query配列の全体を表示する場合には、何も入力しないでください。
- <image width> (Integer)
画像幅の指定
画像の幅を指定することが出来ます。(単位:ピクセル)
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