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配列数 : 4,783,187
Program
blastn (DNA query vs. DNA database)
tblastx (DNA query[translated into protein] vs. DNA database[translated into protein])
tblastn (Protein query vs. DNA database[translated into protein])
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Standard (1)
Vertebrate Mitochondrial (2)
Yeast Mitochondrial (3)
Mold Mitochondrial; ... (4)
Invertebrate Mitochondrial (5)
Ciliate Nuclear; ... (6)
Echinoderm Mitochondrial (9)
Euplotid Nuclear (10)
Bacterial (11)
Alternative Yeast Nuclear (12)
Ascidian Mitochondrial (13)
Flatworm Mitochondrial (14)
Blepharisma Macronuclear (15)
Expect
Frame shift penalty
for blastx
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
25
30
50
1000
No OOF
Matrix
PAM30
PAM70
BLOSUM80
BLOSUM62
BLOSUM45
Other options:
Options for BLASTScope
Sort Hits order by :
Hit Number
bit score
query from
definition
alignment length
Number of Hits :
All Hits
Limit :
Hits
Number of HSPs :
All HSPs
Limit :
HSPs
Limit results by alignment length :
>
Limit results by range of query sequence :
-
Image width :
BioResource Databases (All clones are available)
ALL
EST/cDNA
実験動物マウス
( 78,174 )
NIA Mouse 7.4K and NIA/NIH Mouse 15K cDNA clones
1-cell Unfertilized Egg
1-cell Fertilized Egg
2-cell Embryo
4-cell Embryo
8-cell Embryo
16-cell Embryo
3.5-dpc Blastocyst
HMI/Ms cDNA
KJR/Ms cDNA
MSM/Ms cDNA
PGN2/Ms cDNA
ツメガエル・イモリ
( 370,069 )
X.tropicalis/embryo
X.lavis/anterior neroectoderm
X.lavis/Keller explants
X.laevis/anterior endomesoderm
X.laevis/wholeembryo(stage 25)
X.laevis/wholeembryo(stage 10.5)
メダカ
( 228,014 )
成魚雄 肝 cDNAクローン
ST22 胚 cDNAクローン
ST35 胚 cDNAクローン
ST40 稚魚 cDNAクローン
成魚 脳 cDNAクローン
成魚雌 卵巣 cDNAクローン
成魚雄 精巣
鰓
腎臓
雌肝臓
脾臓
肝臓ライブラリー
雌個体ライブラリー
稚魚 full-length ライブラリー
稚魚ライブラリー
胚ライブラリー
雌雄成魚全身
培養細胞
培養細胞 20J/m2 UV ± PR
卵巣
雌雄肝臓
培養細胞 gamma-irradiation
7日胚
孵化日全身
成魚卵巣
孵化5日全身
孵化10日全身
孵化15日全身
241920 entries
ショウジョウバエ
( 190,096 )
auraria adult cDNAクローン
sechellia adult cDNAクローン
simulans adult cDNAクローン
simulans larvae cDNAクローン
カイコ
( 20,635 )
bmmt
bmnc
bmov
bmte
fcaL
fmgV
fner
線虫
ニッポンウミシダ
シロイヌナズナ / 植物培養細胞・遺伝子
( 625,394 )
シロイヌナズナcDNAクローン
ヒメツリガネゴケcDNAクローン
ポプラcDNAクローン
タバコEST
many plants cDNA
キャッサバ完全長cDNAクローン
T. halophila完全長cDNAクローン
Brassica rapa完全長cDNAクローン
Striga hermonthica 完全長cDNAクローン
ミナトカモジグサ 完全長cDNA
コムギ
( 562,707 )
EST
オオムギ
( 139,933 )
Haruna Nijo, germination, shoots EST
Haruna Nijo, second leaf stage, seedling leaves EST
Haruna Nijo, adult or heading stage, top three leaves EST
Akashinriki, vegetative stage, leaves EST
H602, adult or heading stage, top three leaves EST
Haruna Nijo, Seedling, Shoot EST
Haruna Nijo, Germination, Root EST
Haruna Nijo, Germination, Shoot EST
Haruna Nijo full-length cDNA
ミヤコグサ
( 185,293 )
cDNAクローン
LjFLcDNAクローン
ダイズ
( 73,373 )
完全長cDNAクローン
トマト
( 59,690 )
Fruit / maturing fruits EST
Fruit / IMG, MG, Orange, Red stages EST
Leaf / pathogen-treated EST
Roots of tomato with/without flower, Fusarium-treated root
アサガオ
( 62,235 )
EST
flower and bud mix
old seedling
細胞性粘菌
( 5,499 )
cDNA
酵母
( 101,079 )
完全長cDNAライブラリ
原核生物（大腸菌）
ヒト・動物細胞
遺伝子材料
Genomic DNA
実験動物マウス
( 468,975 )
MSM/Ms Mouse BACクローン
B6N Mouse BACクローン
ラット
( 558,758 )
Rattus norvegicus F344/Stm
Rattus norvegicus LE/Stm
ニホンザル
( 167,159 )
BACクローン
ツメガエル・イモリ
メダカ
( 551,547 )
BACクローン
Fosmidクローン
ショウジョウバエ
( 72,127 )
ananassae
auraria
melanogaster
sechellia
simulans
シロイヌナズナ / 植物培養細胞・遺伝子
ミヤコグサ
( 46,569 )
BACクローン
TACクローン
ミヤコグサ根粒菌プラスミドクローン
ダイズ
( 8,622 )
ダイズ根粒菌BACクローン
ダイズ根粒菌コスミドクローン
トマト
( 93,682 )
Micro-Tom由来BACクローン
酵母
( 113,551 )
分裂酵母ゲノムDNAクローン
ウイルス
その他の微生物
ヒト・動物細胞
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